スポンサーリンク
スポンサーリンク

単位系

このファイルは、LAMMPS コード内部で主要な変数や方程式に用いられる単位を説明します。入力コマンドのパラメータで使用する単位は input_commands ファイルで説明しています。「units」コマンドで慣用単位系と Lennard-Jones(LJ)単位系を切り替えます。データファイルや入力スクリプトから与える力場パラメータの単位については force_fields ファイルも参照してください。

慣用単位:

距離 = オングストローム
時間 = フェムト秒
質量 = g/mol
温度 = K
圧力 = 気圧
エネルギー = kcal/mol
速度 = オングストローム/フェムト秒
力 = g/mol * オングストローム/フェムト秒^2
電荷 = ±1.0 が陽子/電子
        
スポンサーリンク

LJ 縮約単位:

距離 = sigma
時間 = 縮約 LJ tau
質量 = 無次元 1.0 に対する比
温度 = 縮約 LJ 温度
圧力 = 縮約 LJ 圧力
エネルギー = epsilon
速度 = sigma/tau
力 = 縮約 LJ 力(sigma/tau^2)
電荷 = 無次元 1.0 に対する比
        

以下の変数一覧は慣用単位を想定しています。LJ 縮約単位に変換するには、上の対応する項目に置き換えてください。例:LJ 単位では x は sigma で表します。どの単位でも「1 モル当たり」とは 6.023 × 10^23 個の原子に対する値を意味します。

意味 変数 単位

位置            x                 オングストローム
速度            v                 オングストローム/クリック(下記参照)
力              f                 kcal / (mol·Å)
質量            mass              g / mol
電荷            q                 電子単位(電子は -1)
(1 電子単位 = 1.602 × 10^-19 C)
        
時間            ---               クリック(1 クリック = 48.88821 フェムト秒)
タイムステップ  dt                クリック
入力タイムステップ dt_in          フェムト秒
時間換算        dtfactor          48.88821 フェムト秒/クリック
        
温度            t_current         K
              t_start
              t_stop
入力ダンピング  t_freq_in         1/フェムト秒
内部温度        t_freq            1/クリック
ダンピング
        
誘電率          dielectric        1.0(無次元)
ボルツマン定数  boltz            0.001987191 kcal / (mol·K)
        
ビリアル        virial[xyz]       kcal/mol = r・F
圧力係数        pfactor           68589.796(内部圧力を気圧に換算)
内部圧力        p_current         kcal / (mol·Å^3)
              p_start
              p_stop
入力圧力        p_start_in        気圧
              p_stop_in
出力圧力        log file          気圧
入力ダンピング  p_freq_in         1/時間
内部圧力        p_freq            1/クリック
ダンピング
        
ポテンシャルエネルギー e_potential kcal/mol
運動エネルギー e_kinetic    kcal/mol
エネルギー換算  efactor           332.0636 (kcal·Å) / (q^2·mol)
(クーロンエネルギーを kcal/mol に換算)
        

LJ 係数 lja, ljb kcal·Å^(6,12)/mol

結合パラメータ  各種             force_fields ファイル参照
(2,3,4 体項)