単位系
このファイルは、LAMMPS コード内部で主要な変数や方程式に用いられる単位を説明します。入力コマンドのパラメータで使用する単位は input_commands ファイルで説明しています。「units」コマンドで慣用単位系と Lennard-Jones(LJ)単位系を切り替えます。データファイルや入力スクリプトから与える力場パラメータの単位については force_fields ファイルも参照してください。
慣用単位:
距離 = オングストローム
時間 = フェムト秒
質量 = g/mol
温度 = K
圧力 = 気圧
エネルギー = kcal/mol
速度 = オングストローム/フェムト秒
力 = g/mol * オングストローム/フェムト秒^2
電荷 = ±1.0 が陽子/電子
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LJ 縮約単位:
距離 = sigma
時間 = 縮約 LJ tau
質量 = 無次元 1.0 に対する比
温度 = 縮約 LJ 温度
圧力 = 縮約 LJ 圧力
エネルギー = epsilon
速度 = sigma/tau
力 = 縮約 LJ 力(sigma/tau^2)
電荷 = 無次元 1.0 に対する比
以下の変数一覧は慣用単位を想定しています。LJ 縮約単位に変換するには、上の対応する項目に置き換えてください。例:LJ 単位では x は sigma で表します。どの単位でも「1 モル当たり」とは 6.023 × 10^23 個の原子に対する値を意味します。
意味 変数 単位
位置 x オングストローム
速度 v オングストローム/クリック(下記参照)
力 f kcal / (mol·Å)
質量 mass g / mol
電荷 q 電子単位(電子は -1)
(1 電子単位 = 1.602 × 10^-19 C)
時間 --- クリック(1 クリック = 48.88821 フェムト秒)
タイムステップ dt クリック
入力タイムステップ dt_in フェムト秒
時間換算 dtfactor 48.88821 フェムト秒/クリック
温度 t_current K
t_start
t_stop
入力ダンピング t_freq_in 1/フェムト秒
内部温度 t_freq 1/クリック
ダンピング
誘電率 dielectric 1.0(無次元)
ボルツマン定数 boltz 0.001987191 kcal / (mol·K)
ビリアル virial[xyz] kcal/mol = r・F
圧力係数 pfactor 68589.796(内部圧力を気圧に換算)
内部圧力 p_current kcal / (mol·Å^3)
p_start
p_stop
入力圧力 p_start_in 気圧
p_stop_in
出力圧力 log file 気圧
入力ダンピング p_freq_in 1/時間
内部圧力 p_freq 1/クリック
ダンピング
ポテンシャルエネルギー e_potential kcal/mol
運動エネルギー e_kinetic kcal/mol
エネルギー換算 efactor 332.0636 (kcal·Å) / (q^2·mol)
(クーロンエネルギーを kcal/mol に換算)
LJ 係数 lja, ljb kcal·Å^(6,12)/mol
結合パラメータ 各種 force_fields ファイル参照
(2,3,4 体項)